霍乱是由霍乱弧菌引起的急性肠道传染病,有轻症、中、重症,以及中毒型病例。感染后,若治疗不及时或不恰当,会引起严重脱水,导致死亡。每年5-10月为我国霍乱高发季节,人群普遍易感,胃酸缺乏者尤其易感。近年来,我国有发病病例,死亡率均为0。
解决方案
霍乱弧菌的鉴定有多种方法,包括微生物学及分子生物学检测,使用qPCR对霍乱CTX毒力基因进行检测是一种快速手段,且基于16S rRNA基因分型在其流行病学研究中有广泛的应用。
核酸提取
QIAamp PowerFecal Pro DNA Kit(51804)
高效裂解粪便和肠容物中所有微生物,帮助获得无偏倚的微生物多样性信息结果。
DNeasy 96 PowerSoil Pro Kit (47017)
可一次纯化96孔板粪便样本中微生物DNA,实现高通量检测。
DNeasy PowerWater Kit (14900-50-NF)
从过滤水,包括混浊水样品中分离微生物DNA,兼容大部分材质的滤膜。
核酸扩增
HotStarTaq DNA Polymerase (203203)
热启动DNA聚合酶,室温下建立PCR体系,*的Q-Solution有助于GC含量高的模板扩增,*的QIAGEN PCR Buffer,将非特异性扩增产物、引物二聚体和其他污染降低。
HotStarTaq Plus DNA Polymerase (203607)
快速热启动酶
图注:HotStarTaq DNA Polymerase系列产品的优秀性能
QuantiNova Probe PCR Kit (208254)
探针法qPCR 试剂,室温下配置体系,*的颜色指示剂,30min完成40个循环,起始量低至单拷贝。
图注:强的扩增稳定性
微生物16S/ITS扩增子测序
QIAseq 16S/ITS Screening Panel (333812)
可筛选16S可变区和ITS区域内全长或任意组合序列,仅需1pg上样量。
图注:不同样本16S/18S引物的扩增结果
图注:同一样本进行稀释后,以不同起始量和PCR cycles进行QIAseq 16S文库构建并测序分析,即使低至1pg起始样本,微生物群组比例分析结果也不会产品明显偏差。
以上资料来源于:中华人民共和国国家卫生行业标准《霍乱诊断标准》、疾病预防控制局
上海优宁维生物科技股份有限公司
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